Kaito Kuroba est un jeune lycéen dont le rêve est de devenir un aussi bon magicien que l’était son père avant de mourir. Huit ans après ce drame, il active, par hasard, un mécanisme et entre dans une pièce secrète. Il découvre que son père a été un voleur sous le nom de Kaitō Kid et qu’il a été assassiné par une mystérieuse organisation. Kaito décide donc d’enfiler le costume de son père et de devenir le Kid à son tour, son but étant de retrouver les assassins de son père.