Tsukishima Jinbei, un apprenti samuraï et fils d’un puissant samuraï, se rends à Edo pour intégrer le Mushibugyo, une agence shogunale chargée d’exterminer les insectes qui infestent la ville et le pays, à la place de son père. Les insectes, en effet, sont d’énormes créatures meurtrières.