La DDS (Dan Detective School) est la seule école du Japon pour futurs détectives. Parmi ses élèves, Kyuu, un garçon dont le rêve est de devenir le meilleur détective de tous les temps, Megumi, une fille à la mémoire photographique, Kazuma, le jeune génie informatique, Kintarou, un spécialiste en arts martiaux et le mystérieux Ryu. Ensemble, ils résoudront plusieurs énigmes qui les mèneront face à Pluto, une organisation criminelle autrefois dissoute par Dan Morihiko (le fondateur de la DDS).