Sho et son ami Tetsurou tombent sur un étrange artefact extraterrestre en marchant dans les bois. Ensuite, l’artefact extraterrestre se libère de ses liens métalliques et pénètre dans le corps de Sho, le transformant en Guyver. Avec ce nouveau pouvoir, Sho doit se battre avec la méchante société Chronos et leurs zoanoïdes génétiquement améliorés, qui cherchent à ramener le Guyver dans leurs laboratoires. Personne près de Sho n’est à l’abri de Chronos. Il doit se battre.